Venäjällä toimivat luterilaiset kirkot, saksalaistaustainen  ELKRAS, Inkerin kirkko sekä Siperian kirkko ja Viron ev.lut. kirkko ovat selvittäneet keskinäistä asemaansa ja sopineet yhteisistä pelisäännöistä. Kirkot sitoutuvat luterilaisiin tunnustuskirjoihin ja kunnioittavat toistensa työtä. Siperian kirkon aluetta ovat  Siperia, Uralin alue ja Kauko-itä. Se välttää seurakuntien perustamista niillä alueilla, missä ELKRAS ja Inkerin kirkko toimivat. Siperian kirkkoa johtaa Vsevolod Lytkin.
Siperian kirkon  pappien ja diakonien ordinaation ovat  vuosina 1993-2006  suorittaneet Viron luterilaisen kirkon arkkipiispat. Lytkin ja hänen työtoverinsa katsoivat itsensä Viron kirkon alaisiksi vuoteen 2004 asti, jolloin perustettiin itsenäinen kirkko.  Lytkinin valinnan piispaksi hyväksyi Viron ev.lut. kirkon kirkolliskokous. Viron kirkko onkin toivonut, että sen yhteys kolmeen Venäjällä toimivaan luterilaiseen kirkkoon voisi olla edelleen kitkatonta ja yhteistyö toimivaa. Kirkot suunnittelevat yhteisiä  konferensseja, joissa pohditaan sekä teologisia että käytännön kysymyksiä.