Diakonia on toimintaa, joka pohjautuu kristilliseen lähimmäisenrakkauteen.  Se on näkyvä ilmentymä uskosta kristityn elämässä.  Kirkon diakoniatyö täytyy kohdistaa sinne, missä hätä on suuri, ja missä se auttaa niitä ihmisiä, jotka eivät saa apua muualta.

Diakoniatoimikunnan tehtävänä on yhdessä muiden toimikuntien sekä Teologisen Instituutin kanssa suunnitella ja kehittää diakoniatyötä seurakunnissa. Toimikuntaan kuuluu kuusi kirkkohallituksen valitsemaa henkilöä ja puheenjohtaja.

Diakoniatoimisto sijaitsee Inkerin kirkon Keskuskanslian tiloissa.  Toimiston työntekijöiden tehtävänä on toteuttaa Diakoniatoimikunnan ja kirkkohallituksen päätöksiä sekä valmistella kokouksiin tulevat asiat.  Diakoniatoimiston työntekijöinä ovat diakoniajohtaja Lilja Stepanova ja sihteeri Aleksandra Maksimova.